微波爐能加熱食物，可能令人覺得連病毒細菌亦可一併殺滅，然而有外國研究團隊就於多部家居及餐廳微波爐抽樣，發現部分含有抗輻射微生物，其中幾種甚至可引致腦膜炎、蜂窩性組織炎等嚴重疾病，建議應以正確方式每星期清洗微波爐。
綜合《每日郵報》等傳媒報道，西班牙公司Darwin Bioprospecting Excellence研究團隊早前從30個微波爐內部採集樣本，其中10個來自家居廚房的微波爐，10個來自餐廳等公共空間，另外10個來自實驗室。
研究團隊於30個微波爐樣本中發現747個不同屬（genera）的微生物；儘管大部分微生物均常見於一般廚房環境，但當中幾種微生物，如克雷伯氏菌、腸球菌及氣單胞菌可能對人類造成危險；克雷伯菌屬可引起一系列感染，導致肺炎、血液感染、傷口或手術部位感染及腦膜炎；腸球菌引致尿道感染、血流感染及傷口感染；氣單胞菌則與胃腸道感染、腎病、蜂窩性組織炎和腦膜炎有關。
微波爐應每星期洗一次
據相關調查，美國90%家庭都擁有微波爐，專家建議至少每星期清潔微波爐一次，但根據其他調查，有3分之1美國人未能做到上述要求。研究團隊指出，有研究顯示微波爐運作時產生的輻射未能消除微生物污染，建議定期以稀釋漂白水或消毒噴霧清潔微波爐，並以濕布抹走微波爐內可見的殘留物，以防止細菌滋生。
「叮」一種物品去除微波爐萬年漬
日本家務網站「saita」就介紹一種簡單方法，利用檸檬酸可中和鹼性污漬作用，開機「叮熱」就能夠去除微波爐內異味，所需用具及步驟如下：
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